Position du problème
L’endo-brachy-œsophage (EBO) est un facteur de risque de cancer de l’œsophage, avec un risque annuel de progression évalué à 1%. La surveillance actuelle des patients avec EBO à faible risque est lourde, peu rentable et dépend de l’évaluation histologique subjective de la dysplasie, avec une grande variabilité inter-observateurs. Cette étude a pour objectif d’identifier les caractéristiques génomiques par séquençage, pour améliorer la stratification des patients à faible risque de progression et envisager des stratégies de surveillance personnalisées.
Méthode
Etude de cohorte multicentrique, avec appariement selon l’âge, le sexe et la longueur du segment de l’EBO.
> Séquençage NGS d’ADN extrait des biopsies d’EBO sans dysplasie, pour détecter les mutations et les modifications du nombre de copies de gènes (délétions homozygotes, amplifications)
> Modèle de régression logistique, avec analyse des covariables et des modèles à effets mixtes pénalisés.
> Modèle conjoint de survie pour analyser les données distribuée dans l’espace et dans le temps
Résultat
L’étude a analysé 331 échantillons de base et 214 échantillons et identifié 105 progresseurs après une médiane de 4 (IQR 2,4-7,2) ans et 115 non-progresseurs, avec suivi médian sans progression de 6 (IQR 4,3-7,3) ans.
Les mutations TP53 prédisent le risque de progression (p < 0,0001, HR = 3,84, IC (95%) 2,89-5,67). idem pour la perte d'une partie du chromosome 17 (p < 0,0001, HR = 4,41, IC 95 % 2,29-8,52).
Un modèle combiné incorporant les mutations TP53, la perte de 17p et la charge mutationnelle a démontré une sensibilité de 57 % et une spécificité de 84 %, avec une AUC de 0,758.
Conclusion
Ce modèle a permis d’identifier 60 des 105 cas de progression chez des patients atteints d’EBO sans dysplasie. La combinaison de l’identification de mutation TP53, par un test faisable en pratique courante, améliore la valeur pronostique, identifiant la majorité des progresseurs parmi les patients avec EBO sans dysplasie, tout en maintenant un taux de faux positifs acceptable
Cette approche pourrait avoir un impact considérable sur la stratification des risques et les stratégies de surveillance mais il manque des études prospectives pour développer un score de risque.